Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TM7SF3Q9NS93 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM7SF3Q9NS93 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms