Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 TRAPPC12-207ENST00000433382 578 ntTSL 519.16■□□□□ 0.663e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 BNIP3-202ENST00000540159 3066 ntTSL 1 (best)19.15■□□□□ 0.663e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.643e-7■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.642e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 AP006621.5-202ENST00000623692 636 ntBASIC18.99■□□□□ 0.633e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.623e-7■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 ZNF672-206ENST00000510904 555 ntTSL 418.87■□□□□ 0.618e-9■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.613e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.613e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TRAPPC4-209ENST00000528230 583 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.573e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.562e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TTLL3-211ENST00000430390 1674 ntTSL 1 (best)18.11■□□□□ 0.493e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.493e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.463e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.443e-7■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 AC109446.3-201ENST00000567344 641 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.433e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 ATP2A3-213ENST00000574202 230 ntTSL 217.71■□□□□ 0.432e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 ZSCAN5A-212ENST00000591078 686 ntTSL 317.7■□□□□ 0.423e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 DDX5-224ENST00000583239 474 ntTSL 417.7■□□□□ 0.423e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 ATP2A3-203ENST00000359983 3290 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.412e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 ZSCAN5A-205ENST00000587340 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.43e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 SYMPK-215ENST00000600237 5164 ntTSL 517.5■□□□□ 0.393e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 ZSCAN5A-209ENST00000588955 576 ntTSL 417.35■□□□□ 0.373e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TRAPPC4-211ENST00000533012 817 ntTSL 217.11■□□□□ 0.333e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.283e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TRAPPC12-204ENST00000415624 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.65■□□□□ 0.263e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.253e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.258e-9■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TRAPPC12-205ENST00000416918 473 ntTSL 316.55■□□□□ 0.243e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.223e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 CIAO1-201ENST00000272402 3588 ntTSL 216.36■□□□□ 0.213e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TRAPPC12-213ENST00000461577 677 ntTSL 216.16■□□□□ 0.183e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TRAPPC4-201ENST00000359005 849 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.173e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 ZSCAN5A-217ENST00000593106 849 ntTSL 516.05■□□□□ 0.163e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TBC1D14-201ENST00000409757 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.153e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 ZSCAN5A-210ENST00000589279 686 ntTSL 215.9■□□□□ 0.143e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TTLL3-221ENST00000455274 2848 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.133e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 HK1-202ENST00000359426 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.133e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.123e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.123e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TTLL3-202ENST00000383827 4834 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.113e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.113e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TTLL3-225ENST00000473661 3811 ntTSL 515.64■□□□□ 0.093e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TTLL3-224ENST00000471058 543 ntTSL 215.63■□□□□ 0.093e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 BAP1-201ENST00000296288 3434 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.083e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.033e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TRAPPC4-206ENST00000525303 654 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.033e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 RSBN1L-203ENST00000445288 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.013e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.013e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 PPIL2-210ENST00000496819 494 ntTSL 1 (best)14.54□□□□□ -0.083e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.093e-7■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.132e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TBC1D14-207ENST00000448507 4887 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.143e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 RNF166-204ENST00000562499 590 ntTSL 414.17□□□□□ -0.143e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 ZSCAN5A-202ENST00000585670 314 ntTSL 314.17□□□□□ -0.143e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 PPIL2-204ENST00000417788 4213 ntTSL 214.03□□□□□ -0.163e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.172e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 WIPI2-213ENST00000488359 602 ntTSL 313.86□□□□□ -0.193e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 BAP1-205ENST00000470173 578 ntTSL 313.8□□□□□ -0.23e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 PPIL2-203ENST00000406385 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.233e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TRAPPC12-223ENST00000497597 3401 ntTSL 213.47□□□□□ -0.253e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TTLL3-232ENST00000496526 5282 ntTSL 213.37□□□□□ -0.273e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 VCPIP1-201ENST00000310421 9942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.273e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 WIPI2-210ENST00000480238 470 ntTSL 313.2□□□□□ -0.33e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 ZSCAN5A-207ENST00000587614 589 ntTSL 413.18□□□□□ -0.33e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 SLC7A1-201ENST00000380752 7347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.338e-9■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 ELF4-202ENST00000335997 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.423e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TRAPPC12-221ENST00000489032 561 ntTSL 312.17□□□□□ -0.463e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 RSBN1L-204ENST00000445512 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 312.09□□□□□ -0.473e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 PPIL2-208ENST00000484439 863 ntTSL 511.96□□□□□ -0.493e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TTLL3-228ENST00000483051 4176 ntTSL 510.89□□□□□ -0.673e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 ZSCAN5A-208ENST00000588442 576 ntTSL 410.3□□□□□ -0.763e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 DDX5-211ENST00000579091 531 ntTSL 49.84□□□□□ -0.833e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TRAPPC12-208ENST00000437733 518 ntTSL 59.45□□□□□ -0.93e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 HK1-216ENST00000493591 916 ntTSL 58.67□□□□□ -1.023e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.173e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 PPIL2-206ENST00000458567 557 ntTSL 47.35□□□□□ -1.233e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 RSBN1L-206ENST00000468035 585 ntTSL 35.3□□□□□ -1.563e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 CD81-214ENST00000530239 425 ntTSL 237.55■■■■□ 3.65e-7■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.175e-7■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 CD81-208ENST00000492252 1136 ntTSL 328.09■■■□□ 2.095e-7■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 CD81-211ENST00000524805 982 ntTSL 527.95■■■□□ 2.065e-7■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.615e-7■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 CD81-210ENST00000493525 396 ntTSL 523.32■■□□□ 1.325e-7■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 PHIP-201ENST00000275034 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.913e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 ERF-203ENST00000593944 555 ntTSL 428.89■■■□□ 2.223e-7■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 ERF-205ENST00000595941 227 ntTSL 412.26□□□□□ -0.453e-7■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TMEM164-208ENST00000497754 236 ntTSL 234.09■■■■□ 3.052e-6■■■■□ 26.3
DROSHAQ9NRR4 BAIAP2-227ENST00000576470 593 ntTSL 231.42■■■□□ 2.624e-6■■■■□ 26.3
DROSHAQ9NRR4 BAIAP2-224ENST00000575989 565 ntTSL 430.26■■■□□ 2.434e-6■■■■□ 26.3
DROSHAQ9NRR4 BAIAP2-221ENST00000575750 584 ntTSL 423■■□□□ 1.274e-6■■■■□ 26.3
DROSHAQ9NRR4 BAIAP2-207ENST00000571530 581 ntTSL 421.28■■□□□ 14e-6■■■■□ 26.3
DROSHAQ9NRR4 BAIAP2-215ENST00000573894 657 ntTSL 319.54■□□□□ 0.724e-6■■■■□ 26.3
DROSHAQ9NRR4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC27.95■■■□□ 2.063e-6■■■■□ 26.3
DROSHAQ9NRR4 TMC6-222ENST00000592076 693 ntTSL 324.81■■□□□ 1.563e-7■■■■□ 26.2
DROSHAQ9NRR4 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.49e-7■■■■□ 26.2
DROSHAQ9NRR4 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.362e-6■■■■□ 26.2
DROSHAQ9NRR4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.128e-7■■■■□ 26.2
DROSHAQ9NRR4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.858e-7■■■■□ 26.2
DROSHAQ9NRR4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.412e-6■■■■□ 26.2
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