Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C5orf42Q9H799 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms