Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC77Q9BR77 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms