Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP2Q99959 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms