Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms