Protein–RNA interactions for Protein: Q96N28

PRELID3A, PRELI domain containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3AQ96N28 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRELID3AQ96N28 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms