Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC114Q96M63 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms