Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT9

IFT43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT43Q96FT9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT43Q96FT9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT43Q96FT9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT43Q96FT9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT43Q96FT9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT43Q96FT9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT43Q96FT9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT43Q96FT9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT43Q96FT9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT43Q96FT9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT43Q96FT9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT43Q96FT9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT43Q96FT9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT43Q96FT9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT43Q96FT9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT43Q96FT9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT43Q96FT9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT43Q96FT9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT43Q96FT9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT43Q96FT9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT43Q96FT9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT43Q96FT9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT43Q96FT9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT43Q96FT9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT43Q96FT9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT43Q96FT9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT43Q96FT9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT43Q96FT9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT43Q96FT9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms