Protein–RNA interactions for Protein: Q96A29

SLC35C1, GDP-fucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C1Q96A29 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC35C1Q96A29 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms