Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms