Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms