Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ0

DUSP18, Dual specificity protein phosphatase 18, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP18Q8NEJ0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP18Q8NEJ0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP18Q8NEJ0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms