Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM20Q8N5G0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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