Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf62Q8N4C0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms