Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC34.27■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
VPS8Q8N3P4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
VPS8Q8N3P4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms