Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF554Q86TJ5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF554Q86TJ5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms