Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SV2BQ7L1I2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms