Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms