Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms