Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SWI5Q1ZZU3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
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