Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 DDX39B-212ENST00000456662 932 ntTSL 59.25□□□□□ -0.933e-6■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 DDX39B-205ENST00000419020 583 ntTSL 39.06□□□□□ -0.963e-6■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 DDX39B-209ENST00000428450 633 ntTSL 48.92□□□□□ -0.983e-6■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 DDX39B-211ENST00000449757 591 ntTSL 38.03□□□□□ -1.123e-6■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 HPN-207ENST00000599363 1828 ntTSL 518.39■□□□□ 0.536e-13■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 HPN-204ENST00000593305 2175 ntTSL 217.17■□□□□ 0.346e-13■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 HPN-203ENST00000541345 1820 ntTSL 214.95□□□□□ -0.026e-13■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.066e-13■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.26e-13■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.576e-13■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.563e-10■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.33e-10■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.023e-10■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 NARS-207ENST00000587675 1002 ntTSL 212.96□□□□□ -0.333e-10■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 NARS-206ENST00000587366 515 ntTSL 410.29□□□□□ -0.763e-10■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 NARS-202ENST00000411676 1097 ntTSL 210.29□□□□□ -0.763e-10■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 NARS-204ENST00000586807 1608 ntTSL 210.04□□□□□ -0.83e-10■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 NARS-201ENST00000256854 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.853e-10■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 NARS-205ENST00000587194 562 ntTSL 49.51□□□□□ -0.893e-10■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 NARS-212ENST00000591599 584 ntTSL 59.51□□□□□ -0.893e-10■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 NARS-203ENST00000540592 937 ntTSL 29.51□□□□□ -0.893e-10■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 NARS-208ENST00000588661 582 ntTSL 58.13□□□□□ -1.113e-10■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 NARS-211ENST00000590123 463 ntTSL 57.51□□□□□ -1.213e-10■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 EIF3J-206ENST00000558227 362 ntTSL 25.54□□□□□ -1.523e-10■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 EIF3J-205ENST00000558053 463 ntTSL 24.66□□□□□ -1.663e-10■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 ASPSCR1-203ENST00000344865 1041 ntTSL 217.36■□□□□ 0.373e-12■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 ASPSCR1-209ENST00000581484 1001 ntTSL 213.35□□□□□ -0.273e-12■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 CCNL1-206ENST00000464679 534 ntTSL 35.2□□□□□ -1.581e-9■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 CCNL1-224ENST00000483789 667 ntTSL 24.42□□□□□ -1.71e-9■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 CCNL1-215ENST00000474539 4799 ntTSL 1 (best)3.96□□□□□ -1.781e-9■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 CCNL1-204ENST00000464316 3843 ntTSL 1 (best)3.34□□□□□ -1.871e-9■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 CCNL1-221ENST00000479052 458 ntTSL 33.01□□□□□ -1.931e-9■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 CCNL1-214ENST00000471247 3671 ntTSL 1 (best)2.48□□□□□ -2.011e-9■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.185e-8■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.315e-8■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 MBNL1-207ENST00000459747 594 ntTSL 412.28□□□□□ -0.445e-8■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.55e-8■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 KPNB1-212ENST00000582126 653 ntTSL 511.82□□□□□ -0.524e-12■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 HNRNPC-209ENST00000554383 1039 ntTSL 57.74□□□□□ -1.171e-12■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 MBNL1-209ENST00000460591 898 ntTSL 37.1□□□□□ -1.275e-8■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 MBNL1-221ENST00000495875 545 ntTSL 27□□□□□ -1.295e-8■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 MBNL1-212ENST00000464596 989 ntTSL 56.78□□□□□ -1.325e-8■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.455e-8■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.535e-8■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.65e-8■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.65e-8■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.75e-8■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.745e-8■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.865e-8■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.885e-8■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.935e-8■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.955e-8■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.955e-8■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.51e-8■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 PLXNB1-218ENST00000485535 3264 ntTSL 210.55□□□□□ -0.721e-8■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.035e-7■□□□□ 10.6
SRSF7Q16629 C21orf59-206ENST00000440966 1082 ntTSL 314.9□□□□□ -0.025e-7■□□□□ 10.6
SRSF7Q16629 C21orf59-207ENST00000458138 863 ntTSL 314.39□□□□□ -0.115e-7■□□□□ 10.6
SRSF7Q16629 C21orf59-202ENST00000300260 1243 ntTSL 214.34□□□□□ -0.115e-7■□□□□ 10.6
SRSF7Q16629 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.325e-7■□□□□ 10.6
SRSF7Q16629 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.565e-7■□□□□ 10.6
SRSF7Q16629 AP000275.2-201ENST00000431216 891 ntAPPRIS P1 TSL 57.17□□□□□ -1.265e-7■□□□□ 10.6
SRSF7Q16629 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.629e-7■□□□□ 10.6
SRSF7Q16629 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.449e-7■□□□□ 10.6
SRSF7Q16629 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.099e-7■□□□□ 10.6
SRSF7Q16629 TRIM28-215ENST00000601150 915 ntTSL 313.43□□□□□ -0.269e-7■□□□□ 10.6
SRSF7Q16629 SPG7-204ENST00000561911 1025 ntTSL 512.86□□□□□ -0.359e-7■□□□□ 10.6
SRSF7Q16629 TRIM28-207ENST00000597136 1552 ntTSL 212.3□□□□□ -0.449e-7■□□□□ 10.6
SRSF7Q16629 SPG7-213ENST00000566221 734 ntTSL 312.18□□□□□ -0.469e-7■□□□□ 10.6
SRSF7Q16629 TRIM28-205ENST00000595028 486 ntTSL 211.86□□□□□ -0.519e-7■□□□□ 10.6
SRSF7Q16629 SPG7-207ENST00000563218 654 ntTSL 510.81□□□□□ -0.689e-7■□□□□ 10.6
SRSF7Q16629 SPG7-222ENST00000569820 2305 ntTSL 510.02□□□□□ -0.819e-7■□□□□ 10.6
SRSF7Q16629 TRIM28-212ENST00000597995 702 ntTSL 29.61□□□□□ -0.879e-7■□□□□ 10.6
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SRSF7Q16629 NCL-201ENST00000322723 4034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.751e-15■□□□□ 10.6
SRSF7Q16629 SETD5-211ENST00000443339 3478 ntTSL 29.45□□□□□ -0.95e-6■□□□□ 10.6
SRSF7Q16629 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.272e-7■□□□□ 10.5
SRSF7Q16629 SSR1-208ENST00000483409 570 ntTSL 410.65□□□□□ -0.72e-7■□□□□ 10.5
SRSF7Q16629 SSR1-203ENST00000462112 1094 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.352e-7■□□□□ 10.5
SRSF7Q16629 SSR1-210ENST00000489567 1893 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.42e-7■□□□□ 10.5
SRSF7Q16629 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.422e-7■□□□□ 10.5
SRSF7Q16629 SSR1-206ENST00000479365 1118 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.522e-7■□□□□ 10.5
SRSF7Q16629 SSR1-209ENST00000488834 585 ntTSL 44.67□□□□□ -1.662e-7■□□□□ 10.5
SRSF7Q16629 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.752e-7■□□□□ 10.5
SRSF7Q16629 ATG4B-219ENST00000479941 374 ntTSL 28.75□□□□□ -1.011e-8■□□□□ 10.5
SRSF7Q16629 LUC7L3-203ENST00000503728 783 ntTSL 55□□□□□ -1.612e-8■□□□□ 10.5
SRSF7Q16629 LUC7L3-222ENST00000513969 419 ntTSL 32.02□□□□□ -2.092e-8■□□□□ 10.5
SRSF7Q16629 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.312e-11■□□□□ 10.5
SRSF7Q16629 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.272e-11■□□□□ 10.5
SRSF7Q16629 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.232e-11■□□□□ 10.5
SRSF7Q16629 FTCD-212ENST00000498355 1936 ntTSL 222.46■■□□□ 1.192e-11■□□□□ 10.5
SRSF7Q16629 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.062e-11■□□□□ 10.5
SRSF7Q16629 HMGCS1-203ENST00000507004 950 ntTSL 211.21□□□□□ -0.618e-8■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.688e-8■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 HMGCS1-202ENST00000433297 3466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.858e-8■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 HMGCS1-204ENST00000507293 708 ntTSL 1 (best)8.88□□□□□ -0.998e-8■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 NUP214-224ENST00000530863 560 ntTSL 53.72□□□□□ -1.818e-8■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.319e-6■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 ABHD5-207ENST00000486764 618 ntTSL 215.6■□□□□ 0.099e-6■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 ABHD5-203ENST00000454293 464 ntTSL 315.31■□□□□ 0.049e-6■□□□□ 10.4
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