Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 WDTC1-204ENST00000472249 628 ntTSL 519.47■□□□□ 0.717e-7■■■■■ 27.3
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PCBP1Q15365 LSR-206ENST00000597446 478 ntTSL 317.83■□□□□ 0.442e-13■■■■■ 27.2
PCBP1Q15365 HDAC7-223ENST00000485796 724 ntTSL 513.9□□□□□ -0.183e-7■■■■■ 27.2
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PCBP1Q15365 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.876e-7■■■■■ 27.1
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PCBP1Q15365 KMT5C-210ENST00000589338 1601 ntTSL 1 (best)20.82■□□□□ 0.923e-6■■■■■ 27.1
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PCBP1Q15365 KANSL1-205ENST00000572904 4973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.91e-6■■■■■ 27.1
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PCBP1Q15365 HDAC7-225ENST00000491464 548 ntTSL 410.86□□□□□ -0.673e-7■■■■■ 27
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PCBP1Q15365 RIPOR1-205ENST00000540839 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.424e-6■■■■■ 27
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PCBP1Q15365 RIPOR1-203ENST00000422602 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.634e-6■■■■■ 27
PCBP1Q15365 RIPOR1-223ENST00000569733 3370 ntTSL 210.96□□□□□ -0.664e-6■■■■■ 27
PCBP1Q15365 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 26.9
PCBP1Q15365 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 26.9
PCBP1Q15365 MDH2-202ENST00000424167 681 ntTSL 213.91□□□□□ -0.189e-27■■■■■ 26.9
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PCBP1Q15365 VPS13D-201ENST00000011700 10969 ntTSL 1 (best)6.37□□□□□ -1.391e-7■■■■■ 26.9
PCBP1Q15365 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.591e-7■■■■■ 26.9
PCBP1Q15365 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.621e-7■■■■■ 26.9
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PCBP1Q15365 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.532e-7■■■■■ 26.9
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PCBP1Q15365 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.777e-8■■■■■ 26.8
PCBP1Q15365 NDUFS7-215ENST00000546172 869 ntTSL 519.74■□□□□ 0.757e-8■■■■■ 26.8
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PCBP1Q15365 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.77e-8■■■■■ 26.8
PCBP1Q15365 NDUFS7-213ENST00000543289 3356 ntTSL 218.42■□□□□ 0.547e-8■■■■■ 26.8
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PCBP1Q15365 NDUFS7-214ENST00000545446 3089 ntTSL 213.55□□□□□ -0.247e-8■■■■■ 26.8
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PCBP1Q15365 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.186e-12■■■■■ 26.8
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PCBP1Q15365 INO80-205ENST00000558357 5503 ntTSL 1 (best)11.35□□□□□ -0.596e-12■■■■■ 26.8
PCBP1Q15365 HM13-206ENST00000460389 1075 ntTSL 515.18■□□□□ 0.029e-9■■■■■ 26.8
PCBP1Q15365 GSE1-204ENST00000411612 872 ntTSL 524.31■■□□□ 1.482e-9■■■■□ 26.7
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PCBP1Q15365 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.493e-8■■■■□ 26.7
PCBP1Q15365 PRRC2A-204ENST00000462617 1015 ntTSL 518.06■□□□□ 0.488e-18■■■■□ 26.7
PCBP1Q15365 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.153e-19■■■■□ 26.7
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PCBP1Q15365 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.222e-9■■■■□ 26.7
PCBP1Q15365 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.322e-9■■■■□ 26.7
PCBP1Q15365 PAFAH1B1-204ENST00000571289 589 ntTSL 213.06□□□□□ -0.323e-19■■■■□ 26.7
PCBP1Q15365 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.392e-9■■■■□ 26.7
PCBP1Q15365 PRRC2A-209ENST00000482441 719 ntTSL 212.58□□□□□ -0.48e-18■■■■□ 26.7
PCBP1Q15365 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.431e-6■■■■□ 26.7
PCBP1Q15365 HCFC1-203ENST00000444191 3624 ntTSL 511.41□□□□□ -0.582e-6■■■■□ 26.7
PCBP1Q15365 PAFAH1B1-206ENST00000572915 1361 ntTSL 1 (best)7.1□□□□□ -1.273e-19■■■■□ 26.7
PCBP1Q15365 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.183e-10■■■■□ 26.7
PCBP1Q15365 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.632e-9■■■■□ 26.7
PCBP1Q15365 PRDX2-203ENST00000466174 1717 ntTSL 1 (best)15.29■□□□□ 0.042e-12■■■■□ 26.7
PCBP1Q15365 PRDX2-202ENST00000334482 784 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.332e-12■■■■□ 26.7
PCBP1Q15365 PRDX2-201ENST00000301522 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.412e-12■■■■□ 26.7
PCBP1Q15365 HOOK2-213ENST00000589765 108 ntTSL 510.02□□□□□ -0.812e-12■■■■□ 26.7
PCBP1Q15365 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.029e-7■■■■□ 26.7
PCBP1Q15365 B4GALT1-201ENST00000379731 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.519e-7■■■■□ 26.7
PCBP1Q15365 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.011e-6■■■■□ 26.6
PCBP1Q15365 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.424e-9■■■■□ 26.6
PCBP1Q15365 HM13-218ENST00000487281 757 ntTSL 317.02■□□□□ 0.324e-9■■■■□ 26.6
PCBP1Q15365 HM13-220ENST00000492709 1248 ntTSL 516.63■□□□□ 0.254e-9■■■■□ 26.6
PCBP1Q15365 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.154e-9■■■■□ 26.6
PCBP1Q15365 HM13-211ENST00000468559 675 ntTSL 514.18□□□□□ -0.144e-9■■■■□ 26.6
PCBP1Q15365 HM13-204ENST00000398174 3792 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.694e-9■■■■□ 26.6
PCBP1Q15365 HM13-225ENST00000619859 455 ntTSL 37.54□□□□□ -1.24e-9■■■■□ 26.6
PCBP1Q15365 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.725e-7■■■■□ 26.5
PCBP1Q15365 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.615e-7■■■■□ 26.5
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