Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PDK3Q15120 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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