Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMED1Q13445 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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