Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms