Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRPFP62306 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms