Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
RPS3AP61247 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS3AP61247 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS3AP61247 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS3AP61247 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS3AP61247 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS3AP61247 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS3AP61247 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS3AP61247 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS3AP61247 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS3AP61247 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS3AP61247 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS3AP61247 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS3AP61247 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS3AP61247 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS3AP61247 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS3AP61247 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS3AP61247 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS3AP61247 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS3AP61247 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS3AP61247 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS3AP61247 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS3AP61247 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS3AP61247 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS3AP61247 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS3AP61247 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS3AP61247 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS3AP61247 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS3AP61247 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS3AP61247 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS3AP61247 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS3AP61247 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS3AP61247 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS3AP61247 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS3AP61247 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS3AP61247 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms