Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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TMEM258P61165 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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