Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSCP56915 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSCP56915 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSCP56915 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSCP56915 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSCP56915 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSCP56915 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSCP56915 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSCP56915 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSCP56915 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GSCP56915 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSCP56915 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSCP56915 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSCP56915 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSCP56915 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GSCP56915 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSCP56915 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSCP56915 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSCP56915 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSCP56915 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GSCP56915 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSCP56915 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GSCP56915 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSCP56915 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GSCP56915 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GSCP56915 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSCP56915 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSCP56915 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSCP56915 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSCP56915 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSCP56915 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSCP56915 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSCP56915 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSCP56915 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSCP56915 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSCP56915 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSCP56915 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSCP56915 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSCP56915 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSCP56915 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSCP56915 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSCP56915 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSCP56915 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GSCP56915 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSCP56915 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSCP56915 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSCP56915 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSCP56915 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSCP56915 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSCP56915 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSCP56915 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSCP56915 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSCP56915 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSCP56915 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSCP56915 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSCP56915 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSCP56915 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSCP56915 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSCP56915 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSCP56915 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSCP56915 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSCP56915 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSCP56915 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSCP56915 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSCP56915 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSCP56915 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSCP56915 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSCP56915 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSCP56915 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSCP56915 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSCP56915 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSCP56915 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSCP56915 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSCP56915 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSCP56915 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSCP56915 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSCP56915 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSCP56915 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSCP56915 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSCP56915 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSCP56915 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSCP56915 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSCP56915 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSCP56915 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSCP56915 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSCP56915 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSCP56915 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSCP56915 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GSCP56915 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GSCP56915 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GSCP56915 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GSCP56915 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GSCP56915 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GSCP56915 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GSCP56915 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GSCP56915 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GSCP56915 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSCP56915 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSCP56915 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSCP56915 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms