Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TTPAP49638 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTPAP49638 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTPAP49638 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTPAP49638 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTPAP49638 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTPAP49638 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTPAP49638 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTPAP49638 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTPAP49638 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTPAP49638 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTPAP49638 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTPAP49638 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTPAP49638 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTPAP49638 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TTPAP49638 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTPAP49638 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTPAP49638 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTPAP49638 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTPAP49638 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTPAP49638 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTPAP49638 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTPAP49638 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTPAP49638 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TTPAP49638 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTPAP49638 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTPAP49638 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTPAP49638 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTPAP49638 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTPAP49638 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTPAP49638 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTPAP49638 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTPAP49638 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTPAP49638 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTPAP49638 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTPAP49638 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TTPAP49638 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TTPAP49638 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTPAP49638 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TTPAP49638 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTPAP49638 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TTPAP49638 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTPAP49638 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTPAP49638 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTPAP49638 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTPAP49638 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTPAP49638 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTPAP49638 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTPAP49638 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTPAP49638 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTPAP49638 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTPAP49638 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTPAP49638 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTPAP49638 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTPAP49638 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTPAP49638 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TTPAP49638 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTPAP49638 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTPAP49638 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTPAP49638 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTPAP49638 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTPAP49638 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTPAP49638 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTPAP49638 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTPAP49638 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTPAP49638 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTPAP49638 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTPAP49638 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTPAP49638 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTPAP49638 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TTPAP49638 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTPAP49638 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTPAP49638 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTPAP49638 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTPAP49638 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTPAP49638 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TTPAP49638 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTPAP49638 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTPAP49638 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTPAP49638 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTPAP49638 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTPAP49638 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTPAP49638 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTPAP49638 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTPAP49638 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTPAP49638 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTPAP49638 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTPAP49638 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTPAP49638 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTPAP49638 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TTPAP49638 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTPAP49638 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTPAP49638 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTPAP49638 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTPAP49638 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTPAP49638 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTPAP49638 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTPAP49638 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTPAP49638 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTPAP49638 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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