Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMUP48645 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMUP48645 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMUP48645 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMUP48645 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMUP48645 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMUP48645 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMUP48645 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMUP48645 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMUP48645 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMUP48645 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMUP48645 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMUP48645 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMUP48645 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMUP48645 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMUP48645 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMUP48645 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMUP48645 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMUP48645 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMUP48645 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMUP48645 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMUP48645 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NMUP48645 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMUP48645 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMUP48645 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMUP48645 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMUP48645 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMUP48645 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMUP48645 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMUP48645 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMUP48645 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMUP48645 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMUP48645 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NMUP48645 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMUP48645 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMUP48645 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMUP48645 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMUP48645 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMUP48645 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMUP48645 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMUP48645 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMUP48645 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMUP48645 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMUP48645 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMUP48645 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMUP48645 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMUP48645 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMUP48645 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMUP48645 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMUP48645 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMUP48645 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMUP48645 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMUP48645 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMUP48645 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMUP48645 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMUP48645 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMUP48645 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMUP48645 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMUP48645 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMUP48645 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMUP48645 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMUP48645 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMUP48645 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMUP48645 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMUP48645 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMUP48645 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMUP48645 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMUP48645 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMUP48645 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMUP48645 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMUP48645 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMUP48645 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMUP48645 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMUP48645 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMUP48645 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMUP48645 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMUP48645 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMUP48645 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMUP48645 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMUP48645 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMUP48645 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMUP48645 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMUP48645 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMUP48645 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMUP48645 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMUP48645 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMUP48645 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMUP48645 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMUP48645 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMUP48645 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMUP48645 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMUP48645 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMUP48645 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMUP48645 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMUP48645 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMUP48645 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMUP48645 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMUP48645 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMUP48645 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMUP48645 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms