Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TM4SF4P48230 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms