Protein–RNA interactions for Protein: P40205

MYCNOS, N-cym protein, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNOSP40205 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MYCNOSP40205 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MYCNOSP40205 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MYCNOSP40205 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MYCNOSP40205 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MYCNOSP40205 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MYCNOSP40205 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCNOSP40205 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCNOSP40205 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCNOSP40205 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCNOSP40205 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCNOSP40205 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCNOSP40205 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCNOSP40205 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCNOSP40205 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCNOSP40205 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCNOSP40205 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCNOSP40205 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCNOSP40205 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCNOSP40205 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCNOSP40205 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCNOSP40205 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCNOSP40205 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCNOSP40205 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCNOSP40205 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCNOSP40205 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCNOSP40205 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCNOSP40205 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCNOSP40205 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCNOSP40205 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCNOSP40205 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCNOSP40205 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms