Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCAP37840 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCAP37840 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCAP37840 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCAP37840 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCAP37840 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCAP37840 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCAP37840 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCAP37840 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCAP37840 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCAP37840 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCAP37840 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCAP37840 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCAP37840 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCAP37840 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCAP37840 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCAP37840 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCAP37840 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCAP37840 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCAP37840 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCAP37840 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCAP37840 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCAP37840 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCAP37840 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCAP37840 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCAP37840 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCAP37840 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCAP37840 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCAP37840 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCAP37840 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCAP37840 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCAP37840 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCAP37840 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCAP37840 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCAP37840 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCAP37840 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCAP37840 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCAP37840 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCAP37840 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCAP37840 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCAP37840 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCAP37840 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCAP37840 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCAP37840 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCAP37840 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCAP37840 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCAP37840 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCAP37840 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCAP37840 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCAP37840 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCAP37840 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCAP37840 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCAP37840 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCAP37840 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCAP37840 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCAP37840 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCAP37840 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCAP37840 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCAP37840 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCAP37840 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCAP37840 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCAP37840 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCAP37840 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCAP37840 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCAP37840 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNCAP37840 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNCAP37840 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNCAP37840 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNCAP37840 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNCAP37840 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SNCAP37840 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNCAP37840 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNCAP37840 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNCAP37840 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNCAP37840 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNCAP37840 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNCAP37840 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNCAP37840 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNCAP37840 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNCAP37840 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SNCAP37840 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNCAP37840 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCAP37840 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCAP37840 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCAP37840 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCAP37840 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCAP37840 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCAP37840 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCAP37840 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCAP37840 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCAP37840 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCAP37840 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCAP37840 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCAP37840 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCAP37840 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCAP37840 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCAP37840 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCAP37840 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCAP37840 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCAP37840 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms