Protein–RNA interactions for Protein: P37088

SCNN1A, Amiloride-sensitive sodium channel subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1AP37088 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNN1AP37088 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms