Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTFRP26992 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CNTFRP26992 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTFRP26992 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTFRP26992 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTFRP26992 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTFRP26992 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTFRP26992 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTFRP26992 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTFRP26992 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTFRP26992 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTFRP26992 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTFRP26992 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTFRP26992 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTFRP26992 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTFRP26992 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTFRP26992 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTFRP26992 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTFRP26992 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTFRP26992 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTFRP26992 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms