Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL3P19876 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL3P19876 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL3P19876 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL3P19876 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL3P19876 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL3P19876 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL3P19876 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL3P19876 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL3P19876 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL3P19876 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL3P19876 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL3P19876 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL3P19876 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL3P19876 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL3P19876 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL3P19876 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL3P19876 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL3P19876 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL3P19876 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL3P19876 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL3P19876 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL3P19876 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL3P19876 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL3P19876 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL3P19876 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL3P19876 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL3P19876 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL3P19876 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL3P19876 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms