Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCL5P13501 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCL5P13501 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCL5P13501 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCL5P13501 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCL5P13501 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCL5P13501 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCL5P13501 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCL5P13501 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCL5P13501 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCL5P13501 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCL5P13501 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCL5P13501 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCL5P13501 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCL5P13501 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCL5P13501 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCL5P13501 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCL5P13501 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCL5P13501 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCL5P13501 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCL5P13501 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCL5P13501 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCL5P13501 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCL5P13501 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCL5P13501 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCL5P13501 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCL5P13501 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCL5P13501 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCL5P13501 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCL5P13501 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCL5P13501 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCL5P13501 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCL5P13501 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCL5P13501 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCL5P13501 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCL5P13501 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCL5P13501 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCL5P13501 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCL5P13501 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCL5P13501 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCL5P13501 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCL5P13501 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCL5P13501 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCL5P13501 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCL5P13501 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCL5P13501 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCL5P13501 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCL5P13501 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCL5P13501 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCL5P13501 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCL5P13501 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCL5P13501 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCL5P13501 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCL5P13501 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCL5P13501 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCL5P13501 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCL5P13501 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCL5P13501 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCL5P13501 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCL5P13501 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCL5P13501 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCL5P13501 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCL5P13501 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCL5P13501 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCL5P13501 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCL5P13501 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCL5P13501 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCL5P13501 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCL5P13501 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCL5P13501 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCL5P13501 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCL5P13501 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCL5P13501 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCL5P13501 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCL5P13501 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCL5P13501 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCL5P13501 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCL5P13501 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCL5P13501 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCL5P13501 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCL5P13501 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL5P13501 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL5P13501 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL5P13501 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL5P13501 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL5P13501 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL5P13501 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL5P13501 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL5P13501 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL5P13501 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL5P13501 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL5P13501 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL5P13501 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL5P13501 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL5P13501 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL5P13501 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL5P13501 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL5P13501 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCL5P13501 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCL5P13501 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms