Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms