Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC2P02655 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APOC2P02655 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOC2P02655 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOC2P02655 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOC2P02655 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOC2P02655 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOC2P02655 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOC2P02655 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOC2P02655 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOC2P02655 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOC2P02655 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOC2P02655 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOC2P02655 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOC2P02655 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOC2P02655 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOC2P02655 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOC2P02655 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOC2P02655 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOC2P02655 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOC2P02655 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
APOC2P02655 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOC2P02655 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOC2P02655 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOC2P02655 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOC2P02655 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOC2P02655 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC2P02655 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC2P02655 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC2P02655 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC2P02655 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC2P02655 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC2P02655 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC2P02655 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC2P02655 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC2P02655 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC2P02655 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC2P02655 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC2P02655 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC2P02655 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC2P02655 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC2P02655 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC2P02655 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC2P02655 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC2P02655 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC2P02655 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC2P02655 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC2P02655 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC2P02655 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC2P02655 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC2P02655 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC2P02655 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC2P02655 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC2P02655 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC2P02655 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC2P02655 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC2P02655 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC2P02655 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC2P02655 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC2P02655 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC2P02655 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC2P02655 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC2P02655 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC2P02655 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC2P02655 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC2P02655 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC2P02655 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC2P02655 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC2P02655 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC2P02655 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC2P02655 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOC2P02655 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOC2P02655 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOC2P02655 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOC2P02655 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOC2P02655 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APOC2P02655 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOC2P02655 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APOC2P02655 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOC2P02655 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOC2P02655 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOC2P02655 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOC2P02655 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOC2P02655 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
APOC2P02655 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOC2P02655 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOC2P02655 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOC2P02655 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOC2P02655 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOC2P02655 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOC2P02655 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOC2P02655 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOC2P02655 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APOC2P02655 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOC2P02655 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOC2P02655 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOC2P02655 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APOC2P02655 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOC2P02655 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOC2P02655 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms