Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP29O95721 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms