Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX6O95503 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX6O95503 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX6O95503 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX6O95503 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX6O95503 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX6O95503 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX6O95503 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX6O95503 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX6O95503 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX6O95503 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX6O95503 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX6O95503 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX6O95503 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX6O95503 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX6O95503 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX6O95503 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX6O95503 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX6O95503 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBX6O95503 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBX6O95503 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBX6O95503 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBX6O95503 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBX6O95503 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBX6O95503 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBX6O95503 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBX6O95503 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX6O95503 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX6O95503 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX6O95503 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX6O95503 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX6O95503 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX6O95503 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX6O95503 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX6O95503 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX6O95503 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX6O95503 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX6O95503 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX6O95503 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX6O95503 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX6O95503 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX6O95503 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX6O95503 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX6O95503 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX6O95503 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX6O95503 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX6O95503 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX6O95503 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX6O95503 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX6O95503 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX6O95503 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX6O95503 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX6O95503 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX6O95503 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX6O95503 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX6O95503 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX6O95503 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX6O95503 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX6O95503 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX6O95503 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX6O95503 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX6O95503 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX6O95503 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX6O95503 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX6O95503 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX6O95503 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX6O95503 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX6O95503 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX6O95503 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX6O95503 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX6O95503 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX6O95503 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX6O95503 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX6O95503 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX6O95503 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX6O95503 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX6O95503 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX6O95503 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX6O95503 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX6O95503 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX6O95503 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX6O95503 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX6O95503 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX6O95503 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX6O95503 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX6O95503 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX6O95503 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX6O95503 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX6O95503 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX6O95503 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX6O95503 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX6O95503 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX6O95503 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX6O95503 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX6O95503 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX6O95503 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX6O95503 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX6O95503 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX6O95503 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX6O95503 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms