Protein–RNA interactions for Protein: O75901

RASSF9, Ras association domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF9O75901 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RASSF9O75901 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RASSF9O75901 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASSF9O75901 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms