Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP3O75386 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP3O75386 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP3O75386 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP3O75386 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP3O75386 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP3O75386 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP3O75386 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP3O75386 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP3O75386 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP3O75386 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP3O75386 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP3O75386 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP3O75386 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP3O75386 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP3O75386 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP3O75386 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP3O75386 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP3O75386 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP3O75386 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP3O75386 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP3O75386 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP3O75386 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP3O75386 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP3O75386 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP3O75386 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP3O75386 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP3O75386 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP3O75386 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP3O75386 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP3O75386 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP3O75386 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP3O75386 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP3O75386 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP3O75386 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP3O75386 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP3O75386 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP3O75386 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP3O75386 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP3O75386 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP3O75386 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP3O75386 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP3O75386 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP3O75386 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP3O75386 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP3O75386 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP3O75386 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP3O75386 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP3O75386 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP3O75386 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP3O75386 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP3O75386 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TULP3O75386 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TULP3O75386 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TULP3O75386 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TULP3O75386 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TULP3O75386 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TULP3O75386 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TULP3O75386 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TULP3O75386 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TULP3O75386 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TULP3O75386 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP3O75386 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP3O75386 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP3O75386 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP3O75386 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP3O75386 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP3O75386 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP3O75386 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP3O75386 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP3O75386 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP3O75386 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP3O75386 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP3O75386 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP3O75386 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP3O75386 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP3O75386 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP3O75386 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP3O75386 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP3O75386 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP3O75386 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP3O75386 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP3O75386 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP3O75386 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP3O75386 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP3O75386 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP3O75386 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP3O75386 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP3O75386 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP3O75386 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP3O75386 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP3O75386 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP3O75386 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP3O75386 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TULP3O75386 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TULP3O75386 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TULP3O75386 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TULP3O75386 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TULP3O75386 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TULP3O75386 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms