Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCO2O43819 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCO2O43819 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCO2O43819 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCO2O43819 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCO2O43819 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCO2O43819 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCO2O43819 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCO2O43819 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCO2O43819 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCO2O43819 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCO2O43819 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCO2O43819 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCO2O43819 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCO2O43819 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCO2O43819 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCO2O43819 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCO2O43819 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCO2O43819 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCO2O43819 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCO2O43819 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCO2O43819 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCO2O43819 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCO2O43819 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCO2O43819 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCO2O43819 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SCO2O43819 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCO2O43819 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCO2O43819 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SCO2O43819 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCO2O43819 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCO2O43819 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCO2O43819 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCO2O43819 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCO2O43819 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCO2O43819 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCO2O43819 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCO2O43819 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCO2O43819 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SCO2O43819 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCO2O43819 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCO2O43819 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCO2O43819 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCO2O43819 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCO2O43819 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCO2O43819 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCO2O43819 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCO2O43819 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SCO2O43819 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SCO2O43819 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCO2O43819 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCO2O43819 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCO2O43819 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCO2O43819 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCO2O43819 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCO2O43819 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCO2O43819 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCO2O43819 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCO2O43819 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCO2O43819 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCO2O43819 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCO2O43819 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCO2O43819 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCO2O43819 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCO2O43819 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCO2O43819 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCO2O43819 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCO2O43819 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCO2O43819 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCO2O43819 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCO2O43819 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCO2O43819 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCO2O43819 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCO2O43819 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCO2O43819 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCO2O43819 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCO2O43819 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCO2O43819 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
SCO2O43819 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCO2O43819 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCO2O43819 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCO2O43819 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCO2O43819 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCO2O43819 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCO2O43819 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCO2O43819 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCO2O43819 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCO2O43819 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SCO2O43819 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCO2O43819 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCO2O43819 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCO2O43819 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCO2O43819 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCO2O43819 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCO2O43819 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCO2O43819 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCO2O43819 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCO2O43819 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCO2O43819 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCO2O43819 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms