Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHOX2AO14813 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms