Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms