Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOC4-APOC2K7ER74 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms