Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
I3L3M4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
I3L3M4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
I3L3M4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
I3L3M4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
I3L3M4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
I3L3M4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
I3L3M4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
I3L3M4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
I3L3M4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
I3L3M4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
I3L3M4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
I3L3M4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
I3L3M4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
I3L3M4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
I3L3M4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
I3L3M4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
I3L3M4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
I3L3M4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
I3L3M4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
I3L3M4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
I3L3M4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
I3L3M4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
I3L3M4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
I3L3M4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
I3L3M4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
I3L3M4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
I3L3M4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
I3L3M4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
I3L3M4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
I3L3M4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
I3L3M4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
I3L3M4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
I3L3M4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
I3L3M4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
I3L3M4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
I3L3M4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
I3L3M4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
I3L3M4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
I3L3M4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
I3L3M4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
I3L3M4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
I3L3M4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
I3L3M4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
I3L3M4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
I3L3M4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
I3L3M4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
I3L3M4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
I3L3M4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
I3L3M4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
I3L3M4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
I3L3M4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
I3L3M4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
I3L3M4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
I3L3M4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
I3L3M4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
I3L3M4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
I3L3M4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
I3L3M4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
I3L3M4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
I3L3M4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
I3L3M4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
I3L3M4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
I3L3M4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
I3L3M4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
I3L3M4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
I3L3M4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
I3L3M4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
I3L3M4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
I3L3M4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
I3L3M4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
I3L3M4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
I3L3M4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
I3L3M4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
I3L3M4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
I3L3M4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
I3L3M4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
I3L3M4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
I3L3M4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
I3L3M4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
I3L3M4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
I3L3M4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
I3L3M4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
I3L3M4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
I3L3M4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
I3L3M4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
I3L3M4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
I3L3M4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
I3L3M4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
I3L3M4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
I3L3M4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
I3L3M4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
I3L3M4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
I3L3M4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
I3L3M4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
I3L3M4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
I3L3M4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
I3L3M4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
I3L3M4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
I3L3M4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms